達瑞服務
達瑞服務
DARUI SERVICE
科研服務
Scientific research and service
微生物研究
Microbiology research
達瑞病原微生物檢測平臺將基于多個平臺打造感染項目的全覆蓋檢測服務品牌,從快速培養,到血清學檢測和核酸檢測,從一代測序,二代測序到三代測序,從低通量的QPCR、核酸質譜到高通量測序,多種組合供臨床選擇,為感染項目保駕護航,主要從以下幾個方面研發:首先三代測序作為基因測序的POCT,打造床邊檢測服務,廣譜檢測不遺漏微生物,結合二代測序基于宏基因組、宏轉錄組和單菌基因組流程,為疾病尋根問底提供更好的依據;然后是核酸質譜平臺微生物檢測流程改良,對于不同科室的小Panel可供臨床選擇,為多樣化服務提供更好的對接;以及快速培養為微生物單菌檢測提供更好的陽性方案,培養作為金標準,快速找到對應的微生物,對于臨床判定增加更好的依據。
微生物研究
第二代測序技術
以Roche公司的454技術、Illumina公司的Solexa技術和ABI公司的Solid技術為標志的第二代測序技術被稱為下一代測序技術(next generation sequencing,NGS)在極大降低了測序成本的同時,還大幅提高了測序速度,并且保持了高準確性,在病原微生物的快速檢測、溯源及傳染病性疾病防控等公共衛生方面發揮越來越大的作用。
454技術的發明人之一Jonathan Rothberg還發明了一種基于半導體芯片的測序技術-Ion Torrent。該項技術僅在信號檢測方面與454技術有所不同,在測序過程中不是通過檢測焦磷酸熒光顯色,而是通過檢測H+信號的變化來獲得序列堿基信息。該技術使用了一種布滿小孔的高密度半導體芯片,可以檢測反應池中的pH值的變化。當離子感受器感受到H+信號,H+信號再轉化為數字信號,從而讀出DNA序列。Ion Torrent相比于其他測序技術來說,不需要昂貴的成像設備,因此,設備成本較低,測序速度快,整個上機測序可在2~3.5 h內完成,ABI公司基于Ion torrent 平臺推出的Ion Proton與S5測序平臺,通量15Gb的通量,運行時間7h,對應的病原微生物二代測序試劑盒和分析解讀軟件,實現了臨床檢測的高度自動化和標準化。
第三代測序技術
以Oxford Nanopore Technologies的納米孔單分子測序技術和PacBio公司的單分子實時測序技術,被稱之為第三代測序技術,其最大的特點是實現了對一個DNA分子的序列測定,也就是說在測序過程無需進行PCR反應來對模板分子進行擴增以擴大檢測信號的強度,這就避免了PCR過程中所引入的偏差(Bias)和錯誤(Error),實現了對特殊序列的DNA片段的測序。納米孔(nanopore)測序技術是近年來發展的最具應用潛力的測序技術,納米孔的直徑非常細小,僅允許單個核酸聚合物通過,因而可以在此基礎上使用多種方法來進行高通量檢測。

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